該局說明，扣繳義務人辦理各類所得憑單資料網路申報時，透過「簡易認證」、「工商憑證」或「組織及團體(XCA)憑證」通過身分驗證後，以扣繳單位信用卡(企業卡)或負責人的信用卡進行線上繳納扣繳稅款，每次繳款以一張信用卡為限，線上繳納稅款不受時間、地點限制，是最便捷又省時的稅款繳納方式。
該局進一步說明，線上繳稅成功後，可於電子申報系統列印「線上繳稅交易成功明細表」或至「網路繳稅服務網站」(https://paytax.nat.gov.tw)查詢扣繳稅款繳納紀錄。該局補充，現行「各類所得憑單資料電子申報系統」支援線上繳納扣繳稅款憑證認證種類(如下表)，供扣繳單位選用參考。
| 居住者：登入申報系統，點選「線上繳稅」鈕進行身分驗證，完成繳稅 |
| 申報系統 |
憑證種類 |
活期存款帳戶 |
信用卡 |
| G1居住者線上繳稅 |
簡易認證 |
|
V |
| 工商憑證 |
V |
V |
| XCA憑證 |
V |
V |
| 非居住者：登入申報系統依提示操作完成線上繳稅及上傳申報 |
| 申報系統 |
憑證種類 |
活期存款帳戶 |
信用卡 |
晶片金融卡 |
| A8非居住者網路申報資料傳送(線上繳稅及上傳申報) |
簡易認證 |
|
V |
V |
| 工商憑證 |
V |
V |
V |
| XCA憑證 |
V |
V |
V |
扣繳單位如有系統操作問題，可撥免費服務電話0809-085188，將有專人為您解答；如有稅務申報問題，請撥免費服務電話0800-000321，該局將竭誠服務。