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農業部組織法經立法院三讀通過，並奉總統5月31日令公布，行政院農業委員會在今(1)日改制為農業部，正式揭牌運作，同時也在今日舉行農業部部長布達典禮，在賴副總統及多位貴賓的見證下，由陳院長頒授任命令並交予印信給農業部部長陳吉仲，隨後由賴副總統、陳院長等貴賓，與陳部長一起為農業部揭牌，完成揭牌儀式；此外，農業部亦於同日下午完成農業部所屬機關（構）首長的布達與宣誓，共同開創臺灣農業發展的新紀元。
農業部的成立，係因應內外在環境挑戰，氣候變遷與區域衝突等相關趨勢，積極強化組織功能，包括為因應2040農業淨零目標、健全糧食安全體系、保護農地及利用發展，故成立「資源永續利用司」為專責單位；為落實寵物管理制度、強化動物福利，增設「動物保護司」專責辦理動物保護業務；另推動農業資訊整合規劃及資訊安全與服務，以強化農業數位轉型，將資訊中心調整為「資訊司」；為確保陸域重要生態系及生物多樣性完整、強化森林及自然碳匯，並永續分享森林生態系服務價值，將林務局、特有生物研究保育中心改制為「林業及自然保育署」及「生物多樣性研究所」；為建構永續發展的農業環境與新農村，並因應氣候變遷挑戰，加強推動治山防災與土石流防災應變與監測等業務，因此將水土保持局改制為「農村發展及水土保持署」等，組設調整與業務強化均係回應現今社會新興發展之重要議題。
賴副總統今日出席農業部揭牌儀式表示，1984年農委會成立，而1988年的520農民運動的七大訴求之一，就是成立農業部，很榮幸見證歷史性的時刻，他要代表蔡感謝幫助農委會升格農業部的每一個人，期許陳部長任重道遠，他特別代表蔡英文總統帶來三句話，希望農業部同仁作為座右銘，第一句是農業部要永遠做農漁民的靠山，持續不斷解決農民的問題，積極提升農民收入，以身為農民為榮；第二句是農為國本，農業部要積極讓農業永續發展，持續運用科技新創等手段提升農業競爭力，面臨氣候變遷和數位轉型，農業部和農漁民站在一起，才能共同面對挑戰；第三句是立部厚生，農業部存在目的是要滿足兩千三百五十萬的國人生活糧食所需，面對氣候變遷，未雨綢繆因應未來糧食危機及早準備，這是農業部不可迴避的責任，期待農業部讓臺灣農業永續發展，農漁民生活更好，糧食安全不會出現危機。
陳建仁院長表示，蔡總統上任以來很關心農業發展和對農民的照顧，2016年以來完成三保一金四大農民福利體系建立，口蹄疫拔針、防堵非洲豬瘟，現在傳統豬瘟也已拔針，希望能成為亞洲唯一三個重大豬隻疫病非疫區的國家，這段期間有農委會和農民的努力才能得到這麼好的成績。農業部不只要讓農漁民過得更好，疫後期間特別預算確保農民生活獲得保障，加強農業建設，讓產業順利轉型，並讓農水路設施越來越好，讓台灣農業韌性不斷增加，期許陳部長領導的農業部團隊，可以用溫暖的心照顧所有農漁民，讓農漁業更加堅韌。
陳吉仲部長表示，農業部成立更要加大力到照顧農漁民，所有基礎建設如冷鏈全面啟動，所有產業競爭力全面提升。面對氣候變遷，全面啟動氣候變遷調適策略，農業部負責七成五的國土，國土及自然保育做好農業就可以永續，國家就可以永續。農村發展要做好，讓農村成為安居樂業的場域，還有寵物出生到死亡都要協助，動保司成立目標會照照顧三百多萬寵物及所有動物福利，在農業永續的路上、壯大臺灣農業的路上，請全國農漁民跟農業部一起來打拼，一起加油。