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中央流行疫情指揮中心今（３）日表示，秋冬防疫專案係要求自機場入境或途經我國機場轉機旅客，不論其身分或來臺目的，均應向航空公司出示COVID-19核酸檢驗報告，並符合當地國邊境檢疫規範，及各航空公司載客契約政策規定，以維護航空安全，同時保全我國防疫成效。
本次媒體所述事件係因少部分外籍航空公司誤解該專案之核酸檢驗報告日期、檢驗方式與檢驗結果等項目所致。交通部民用航空局已與該外籍航空公司聯繫，該公司表達可能係新制實施第1、2個航班，部分人員對作業細節仍不熟悉，該航空公司總公司已重新布達相關單位，避免類似情形再次發生。
指揮中心也再次說明，新聞中所提「RT-PCR」為COVID-19核酸檢驗最常見的技術，亦為國際間普遍使用之COVID-19核酸檢驗名稱。而指揮中心於今（2020）年7月要求外籍人士入境需備核酸檢驗報告時，即於COVID-19網站專區英文網頁以 COVID-19 RT-PCR test作為該項檢測之英譯名稱。另為避免各國實驗室檢驗技術或名稱差異所導致之誤解，另於該署外網中英文問答輯（FAQs）明列我國可以接受國外檢驗報告註記之COVID-19核酸檢驗名稱包括「PCR、Real-Time PCR、RT-PCR、RT-qPCR （Quantitative Reverse Transcription PCR）、NAA（Nucleic acid Amplification）、NAAT（Nucleic acid Amplification Test）、NAT（Nucleic acid Test）、LAMP（Loop/Mediated isothermal Amplification）或Molecular Diagnostics等」，秋冬防疫專案亦依前述內容，於COVID-19網站專區完整呈現，供各界參考了解。