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環保署鹿林山背景監測站的地理位置特殊，可觀測污染物跨境傳輸，秋冬季東北風帶來的中國污染物影響及春季高層西風挾帶東南亞生質燃燒影響我國空氣品質。自2006年建站迄今，16年來長期監測溫室氣體及空氣污染物，也加入多項國際聯合監測網絡，累積豐碩的監測數據及研究成果，對於瞭解國際背景空氣品質污染趨勢及進行區域性環境監測合作有極大助益，為守望西太平洋自由大氣成分變化與氣候變異的重要測站。
鹿林山背景監測站受邀加入美國海洋與大氣總署之碳循環溫室氣體採樣網(Carbon Cycle Greenhouse Gases, CCGG)，也是亞洲8站中唯一東亞高山背景測站，另也加入聯邦氣膠監測網(Federated Aerosol Network, FAN)、美國太空總署之太陽輻射監測網(Solar Radiation Network, SolRad-Net)與氣膠輻射監測網(AErosol RObotic NETwork, AERONET)、美國環保署及美國國家大氣沉降計畫(National Atmospheric Deposition Program,NADP)之大氣汞監測網(Atmospheric Mercury Network,AMNet)，並參與多項國際大型實驗，也開展與德國、日本長期觀測合作。
環保署表示，鹿林山測站座落於嘉義與南投交界、玉山國家公園內，位於海拔2862公尺的自由對流層中，長期監測溫室氣體、輻射通量、大氣汞、氣膠等空氣污染物，在國際碳循環溫室氣體監測網可看見該測站數據被引用且發表在國際知名的學術期刊約有60篇，包括環境科學與技術(ES&T)、整體環境科學(STOTEN)、大氣化學和物理(ACP)等知名期刊共10篇，不僅顯示我國背景監測之國際地位及重要性，亦成為相關科學研究的重要國際平台。
環保署表示西元2006年前，東亞區域無溫室氣體及空氣污染背景監測資料，設置鹿林山測站能評估東亞污染跨境傳輸的影響，監測發現2006~2022年鹿林山測站夏季溫室氣體的背景值與夏威夷背景站(Mauna Loa, MLO)一致，不過由於臺灣地理位置特殊，鹿林山測站較夏威夷背景站易受到境外污染影響，在春季東南亞生質燃燒對鹿林山二氧化碳濃度的貢獻約有3.4 ppm、甲烷濃度的貢獻則約為29.5 ppb，長期資料顯示亞洲溫室氣體的濃度是呈現加速成長的趨勢，突顯臺灣鹿林山測站為長期守望區域溫室氣體的重要位置，及肩負監測空氣品質的重要任務。