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臺北關為確保存棧貨物安全、精進門禁管制措施，自111年4月起，於華儲股份有限公司、長榮空運倉儲股份有限公司、遠雄航空自由貿易港區股份有限公司等三大空運貨棧實施電子化門禁管理措施；除公務機關及貨棧人員外，其餘人員進出貨棧均需持憑該關核發之IC卡通行證，於使用期間內，得憑證並經貨棧保全查核、登記後，方可進出貨棧。另為簡便進倉人員登記及審核，該關特委外建置「臺北關貨棧門禁管理系統」（https://ptwcs.tradevan.com.tw/），進倉人員可於進入貨棧2小時前，先至前開網址辦理登記或申請，再親持貼有相片之相關證件（例如，身分證或健保卡等），向該關各駐庫辦公室換取IC卡通行證。
另為強化倉間人員辨識，該關推動報關、承攬業等從業人員於倉間須著公司制服與各貨棧、倉專屬背心，藉以控管人員跨倉移動，並減低人員擅闖貨棧之風險。
臺北關為兼顧貨物移動安全及貿易便捷，推動上開強化進出口貨棧門禁精進措施，以全面防堵走私調包等不法情事。該關再次籲請相關業者全力支持海關邊境管理及通行證改革新制，共同營造便捷與安全的通關環境。
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